反渗透膜生物污染是反渗透用户经常遇到的一个问题，特别是当进水水温高（如夏季）、进水中微生物含量多（如污水回用）的时候。当反渗透膜发生生物污染的时候，反渗透膜的脱盐率降低、透水率下降，需要频繁的化学清洗去恢复反渗膜的性能。